市民活動センター神戸は、様々な団体と連携しながら活動を進めていますが、同時に、いくつかのネットワーク組織の事務局を受託する形で、コーディネートにも務めています。

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ひょうご市民活動協議会 （愛称：HYOGON=ひょうごん） 県内のNPO／NGOが分野を超えてつながり、市民活動の基盤強化を共同で進めるために設立されたネットワーク組織です。KECは36の構成団体の一つとして、事務局を務めています。市民活動団体・マスコミ・企業・行政・関心のある個人など誰でも登録可能な無料メーリングリストを開設していますので、登録希望の方は＜hyogon_office@yahoo.co.jp＞までお知らせ下さい！！

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(特）しみん事業サポートネットワーク (SBSN=Social Buissiness Support Network） 神戸、阪神間で活動する市民団体が、市民事業を育成、発展させる ことを目的に設立したネットワーク組織です。現在30団体が参加。KECは事務局を務めると同時に、生きがいしごとサポートセンター神戸西“わ〜す”（兵庫県委託事業）事業を運営 し、「社会に役立つ活動をしごとに育てます」をモットーにコミュニティ・ビジネスへの求人求職・起業・経営支援を行っています。

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市民社会推進機構 （CAS=Civic Action Syndicate） 自律した市民による市民社会の構築、推進を目的にしたネットワークです。前身である「震災復興市民検証研究会」がまとめた60項目のアクションプランを、NPOスタッフやマスコミ関係者のメンバーがそれぞれの持ち場で実行することをめざしています。KECは事務局を担当してきましたが、2004年度より中心メンバーが震災10年市民検証研究会（事務局：（特）都市生活コミュニティセンター）を設立し、活動を引き継いでいます。 →『市民社会をつくる−震後KOBE発アクションプラン』好評発売中！！ 　復興支援に関わってきたNPO／NGOやジャーナリストらによる、一年半に渡った「市民検証」の成果がまとまりました。市民社会の構築に向かう15の市民団体の群像と60のアクションプラン満載！！